參考周期：常規(guī)試驗7-15工作日,，加急試驗5個工作日,。

注意：因業(yè)務(wù)調(diào)整,暫不接受個人委托測試,望諒解(高校、研究所等性質(zhì)的個人除外),。

檢測項目

基因組提取質(zhì)量評估：

• DNA濃度檢測：≥20ng/μl（UV分光光度法，參照ISO 21571）
• 純度分析：A260/A280比1.8-2.0（A260/A230比≥2.0）

• 平均測序深度：≥30X（覆蓋率≥99.5%）
• Q30分值比例：≥85%（Phred質(zhì)量評分體系）
• Reads長度一致性：150bp±5bp（Illumina平臺標準）

• SNPs檢測：變異等位頻率≥5%,，敏感度≥95%（參照GB/T 34796）
• InDels檢測：長度1-50bp,，檢出率≥90%
• 結(jié)構(gòu)變異分析：SV大小≥50bp,，準確率≥98%

• N50長度：≥100kb（PacBio平臺標準）
• 拼接錯誤率：≤0.1%（比對參考基因組）
• Contig數(shù)量：≤500個（基因組完整性指標）

• 基因預(yù)測準確率：≥95%（BLAST e-value≤1e-10）
• 功能富集分析：GO/KEGG注釋完整性≥90%

• 外源DNA比例：≤0.5%（kraken2分析）
• 宿主殘留檢測：無檢出（針對純培養(yǎng)樣本）

• 重復(fù)序列比例：報告百分比（RepeatMasker工具）
• 轉(zhuǎn)座子檢測：數(shù)量統(tǒng)計（≥95%覆蓋率）

• 16S rRNA一致性：≥99%（針對細菌菌株）
• 多基因座序列分型：MLST分型準確率≥98%

• RAW數(shù)據(jù)格式：FASTQ壓縮比≥80%
• 結(jié)果輸出：VCF/BED格式標準

• 生物安全合規(guī)：符合生物風(fēng)險等級要求
• 數(shù)據(jù)隱私加密：AES-256標準

檢測范圍

1. 革蘭氏陽性細菌菌株： 涵蓋枯草芽孢桿菌等，重點檢測孢子形成基因和抗生素抗性位點,，確?；蚪M穩(wěn)定性。

2. 革蘭氏陰性細菌菌株： 如大腸桿菌,，側(cè)重毒力因子基因和代謝途徑分析,，評估致病風(fēng)險。

3. 酵母菌株： 包括釀酒酵母,，關(guān)注發(fā)酵相關(guān)基因簇和染色體結(jié)構(gòu)變異,，強調(diào)功能注釋完整性。

4. 絲狀真菌菌株： 如曲霉屬,，檢測次級代謝產(chǎn)物基因簇和產(chǎn)毒基因區(qū)域,，側(cè)重組裝質(zhì)量。

5. 放線菌菌株： 如鏈霉菌,，用于抗生素生產(chǎn),，重點分析生物合成基因島和啟動子序列。

6. 乳酸菌菌株： 應(yīng)用于發(fā)酵食品,，檢測益生功能基因和質(zhì)粒穩(wěn)定性,，強調(diào)污染監(jiān)測。

7. 古菌菌株： 如產(chǎn)甲烷菌,，側(cè)重極端環(huán)境適應(yīng)基因和代謝網(wǎng)絡(luò),，評估組裝準確性。

8. 工程改造菌株： 如轉(zhuǎn)基因大腸桿菌,，檢測外源基因插入位點和表達調(diào)控元件,，確保合規(guī)性。

9. 環(huán)境樣本分離菌株： 從土壤或水體提取,，分析多樣性基因和污染物降解通路,，關(guān)注變異檢測。

10. 臨床病原菌株： 如金黃色葡萄球菌,，重點檢測耐藥基因和毒力因子,，強調(diào)功能驗證。

檢測方法

國際標準：

• ISO 20395:2019 Biotechnology - Requirements for evaluating the performance of sequencing methods（涵蓋測序深度和誤差控制）
• ISO 21571:2005 Foodstuffs - Methods of analysis for the detection of genetically modified organisms（DNA提取純度標準）
• ISO/IEC 17025:2017 General requirements for the competence of testing and calibration laboratories（數(shù)據(jù)完整性框架）

• GB/T 34796-2017 高通量測序方法通則（測序參數(shù)要求,，如覆蓋率≥99.5%,，與國際標準深度閾值差異）
• GB 4789.2-2016 食品微生物學(xué)檢驗方法（樣本處理規(guī)范，側(cè)重污染控制,，與國際ISO 21571純度方法兼容）
• GB/T 35537-2017 生物樣本DNA提取技術(shù)通則（濃度檢測標準,，參數(shù)與國際一致）

檢測設(shè)備

1. 高通量測序儀： Illumina NovaSeq 6000（通量6Tb/run,，讀長2x150bp）

2. 第三代測序儀： PacBio Sequel II（讀長≥10kb，準確率99.9%）

3. DNA提取工作站： QIAcube HT（樣本容量96孔,，純度檢測精度±0.01）

4. 生物分析儀： Agilent 2100 Bioanalyzer（DNA片段大小50-7000bp,，分辨率±5bp）

5. 熒光定量儀： Thermo Fisher Qubit 4.0（檢測限≥10pg/μl，線性范圍0.1-1000ng/μl）

6. PCR擴增儀： Bio-Rad T100（溫度精度±0.1°C,，升降溫速率4°C/s）

7. 高速離心機： Eppendorf 5424 R（最大轉(zhuǎn)速15000rpm,，容量24x1.5ml）

8. 超低溫儲存設(shè)備： Thermo Scientific -80°C冰箱（溫度穩(wěn)定性±1°C，容量700L）

9. 生物安全操作柜： ESCO Class II A2（風(fēng)速0.5m/s,，HEPA過濾效率99.99%）

10. 數(shù)據(jù)分析服務(wù)器： Dell PowerEdge R740（內(nèi)存512GB,，存儲容量100TB，處理速度5GHz）

11. 電泳系統(tǒng)： Bio-Rad CHEF-DR III（電壓范圍10-200V,，分辨率1bp-10Mb）

12. 核酸濃度檢測儀： NanoDrop One（波長范圍190-840nm,，精度±2%）

13. 自動化液體處理系統(tǒng)： Tecan Freedom EVO（移液精度±0.5μl，通量384孔）

14. 恒溫培養(yǎng)箱： Memmert IN110（溫度范圍-10°C至100°C,，均勻度±0.3°C）

15. 顯微鏡系統(tǒng)： Olympus BX53（放大倍數(shù)1000X,，分辨率0.2μm）

北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所【簡稱：中析研究所】

報告：可出具第三方檢測報告(電子版/紙質(zhì)版)。

檢測周期：7~15工作日,，可加急,。

資質(zhì)：旗下實驗室可出具CMA/CNAS資質(zhì)報告。

標準測試：嚴格按國標/行標/企標/國際標準檢測,。

非標測試：支持定制化試驗方案,。

售后：報告終身可查，工程師1v1服務(wù),。

中析儀器 資質(zhì)